從王注《素問》林億等新校正及林億等校正《甲乙經》、《脈經》與日本《醫心方》所引考補，當在今本所缺七卷中。其各書所引，仍逐條附註於下，以便稽考。

飲食有常節，起居有常度，不妄不作。（以理而取聲色芳味，不妄視聽也。循理而動，不為分外之事。平按：此條見《素問》卷一第一《上古天真論》。）

上古聖人之教也，下皆為之。（上古聖人使人行者，身先行之，為不言之教。不言之教，勝有言之教，故下百姓仿行者眾，故曰下皆為之。平按：此條見同上。）

身肌宗一。（真人身之肌體，與太極同質，故云宗一。平按：此條見同上。）

有至人者。（積精全神，能至於德，故稱至人。平按：此條見同上。）

帝曰：余聞上古聖人，論理人形，列別臟腑，端絡經脈，會通六合，各從其經，氣穴所發，各有處名，溪谷屬骨，皆有分起，分部逆從，各有條理，四時陰陽，盡有經紀，外內之應，皆有表裡，信其然乎？（平按：此條見《素問》卷二第五《陰陽應象大論》。又按新校正云：詳帝曰至信其然乎，全元起本及《太素》在上古聖人之教也上。）

在變動為握。（握、憂、噦、咳、慄五者，改志而有，名曰變動也。平按：此條亦見《素問》卷二第五。）

脈生脾。（平按：此條見同上。）

在變動為憂。（心之憂在心變動，肺之憂在肺之志，是則肺主於秋，憂為正也；心主於夏，變而生憂也。平按：此條見《素問》同上。又楊氏此注，亦見《甲乙經》卷一第一。）

東方，風傷筋，酸傷筋。中央，濕傷肉，甘傷肉。南方，熱傷氣，苦傷氣。北方，寒傷血，咸傷血。西方，熱傷皮毛，辛傷皮毛。（平按：此條見《素問》同上。又按《素問》新校正云：「凡此五方所傷，《太素》俱云自傷。」袁刻云：自傷似亦註文。）

中央生濕。（六月，四陽二陰，合蒸以生濕氣也。平按：此條見同上。）

濕生土。（四陽二陰，合而為濕，蒸腐萬物成土也。平按：此條見同上。）

在變動為噦。（噦，氣忤也。平按：此條見同上。）

燥傷皮毛，熱勝燥。（平按：此條見同上。）

寒傷骨。（平按：此條見同上。）

濕勝寒。（平按：此條見同上。又按：寒傷骨、濕傷寒兩條，袁刻脫。）

咸傷骨。（平按：此條見同上。）

左右者，陰陽之道路也。（陰氣右行，陽氣左行。平按：此條見同上。）

肖者濯濯。（平按：此條見《素問》卷三第八《靈蘭秘典論》。）

神之處。（平按：此條見《素問》卷三第九《六節藏象論》。）

又按：《素問·六節藏象論》為陽中之太陰，新校正引《太素》太陰作少陰；為陰中之少陰，新校正引《太素》少陰作太陰；此為陽中之少陽，新校正引《太素》作陰中之少陽，三條。平從楊惺吾氏所獲日本仁和寺宮御藏本殘卷十三紙中檢出，補入本書卷三第二《陰陽合》篇，故此三條不復列入。